外資メーカーの日本法人に新卒で入社し、その後本社に転籍することは、どれほど一般的な選択肢ですか？

ご質問いただき、ありがとうございます。
会社によるとしか言えませんが、正直なところ、かなり本社に転籍することは少ないですね。
本社から考えると日本法人での採用はあくまで海外の支店で採用を行ったような感覚なのであまり本社に転籍させることを前提にしていないためです。

私の会社ではかなり稀でした。数百人に一人ほど。

本社出向でさえ事例が少ないのに、ましてや本社の転籍なんて滅多にないかと。海外で勤務しないなら日系メーカーで海外の支社長やるとかの方がよっぽど現実的ですよ。

私の勤めている会社ではあまり一般的ではないと思います。海外の本社に行って数年で帰ってくるというのが一般的に思います。
実際、外資系メーカーで働いていて、日本法人は海外から人が来る場所だなと感じています。
質問者様が外資メーカーの本社で働きたいという強い思いがあるのであれば、ぜひ目指して欲しいと思います。
ただ、海外で働きたいという場所の話であれば、もしかすると日系企業の方が可能性が高いのではとさえ思います。