信託銀行に入社する予定ですが、アセマネに転職するためには市場部門もしくは年金部門に携わるのがベストでしょうか。

そうですね。そのどちらかが良いと思います。というかそれ以外のセクションからは多分転職できないです。
アセマネには信託銀行出身者めちゃくちゃ多いですから、業務経験さえ積めば転職は容易だと思います。